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思影科技腦電機(jī)器學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)處理業(yè)務(wù)

2020-05-12

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一、數(shù)據(jù)質(zhì)量檢查和預(yù)處理

  數(shù)據(jù)質(zhì)量檢查包括:檢查是否存在壞的導(dǎo)聯(lián)、Marker信息是否完整、信號(hào)是否有過(guò)大的波動(dòng)或漂移等。

  數(shù)據(jù)預(yù)處理包括:數(shù)據(jù)導(dǎo)入(格式轉(zhuǎn)換)、定位電極、濾波、重參考、分段、手工去除偽跡(壞段、壞導(dǎo)聯(lián))、偽跡校正(基于ICA去眼電等)。

       注:預(yù)處理步驟可根據(jù)實(shí)際實(shí)驗(yàn)任務(wù)加以調(diào)整。

 

二、EEG基礎(chǔ)指標(biāo)計(jì)算

1)計(jì)算ERP波幅。對(duì)于事件相關(guān)的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),通過(guò)疊加平均的方式,計(jì)算特定刺激誘發(fā)的ERP波幅。

2)計(jì)算功率譜。對(duì)于靜息態(tài)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),通過(guò)傅里葉變換,計(jì)算各波段(delta ~ gamma)的功率譜密度(PSD)。

3)計(jì)算時(shí)頻特征。通過(guò)短時(shí)傅里葉變換(或小波變換),計(jì)算時(shí)頻圖(power)。

4)計(jì)算功能連通性(腦網(wǎng)絡(luò))。對(duì)于靜息態(tài)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),計(jì)算通道之間的功能連通性,所有通道之間的功能連通性可構(gòu)成腦網(wǎng)絡(luò)。功能連通性的計(jì)算方式可選:相干(Coherence)、相位鎖定值(PLV)等。


三、   特征構(gòu)建與特征篩選3.1 特征構(gòu)建

1.ERP特征。計(jì)算感興趣通道的ERP幅值后,每個(gè)時(shí)間點(diǎn)的ERP幅值可以作為一個(gè)特征。

2. 功率譜特征。計(jì)算各區(qū)域(或各通道)在每個(gè)波段(delta ~ gamma)的功率譜。單一區(qū)域(或通道)的某波段的平均絕對(duì)/相對(duì)功率譜密度(PSD/rPSD),可以作為一個(gè)特征。區(qū)域的分辨率可調(diào)節(jié)(如按照10-5、10-20系統(tǒng)選擇通道)。


圖示.各組別各波段的功率譜密度分布。

  3.信息論特征。計(jì)算各區(qū)域(或各通道)的排列熵,Kolmogorov復(fù)雜度等指標(biāo),每個(gè)區(qū)域(或通道)的信息論指標(biāo)可以作為一個(gè)特征。    

4.地形圖特征。計(jì)算時(shí)域或頻域幅值的地形圖,使用地形圖或其衍生指標(biāo)(如GFP,Global Field Power)作為特征。   

   5.腦網(wǎng)絡(luò)。將每個(gè)通道視為一個(gè)節(jié)點(diǎn),節(jié)點(diǎn)之間的聯(lián)系(功能連通性)視為一條連邊,每條連邊即為一個(gè)特征。


圖示. 頻譜、信息論、功能連通性等多種特征的組合。

  6.RQA特征。對(duì)于各通道的靜息態(tài)數(shù)據(jù),基于相位空間構(gòu)建遞歸圖,進(jìn)行遞歸量化分析(Recurrence quantification analysis),提取遞歸率(RR)、決定論(DET)、熵(ENTR)、分層性(LAM)等作為特征。 

3.2 特征篩選    

1.相關(guān)法。計(jì)算每個(gè)特征與量表的相關(guān)性(如皮爾遜相關(guān)),保留相關(guān)值高的特征。    

2.參數(shù)檢驗(yàn)法。對(duì)不同組別人群的特征做假設(shè)檢驗(yàn)(比如對(duì)兩組人群的特征做雙樣本T檢驗(yàn)),保留通過(guò)假設(shè)檢驗(yàn)的特征。    

3.主成分分析(PCA)法。將所有特征分解成一系列主成分,保留排名靠前的主成分作為特征。   

4.遞歸特征消除法。循序漸進(jìn)地刪除影響最小的特征,直至保留特定數(shù)目的最重要的特征為止。注:我們可以提供的特征構(gòu)建、特征篩選方法包括但不限于上述描述,您可以選擇其中一種或多種進(jìn)行組合。
三、機(jī)器學(xué)習(xí)模型    

1.K近鄰k-Nearest Neighbor,KNN)。K近鄰是一個(gè)比較基礎(chǔ)的分類算法,該算法計(jì)算測(cè)試樣本與已知樣本之間的距離,并將測(cè)試樣本判定為與其距離最近的類別。   

2.決策樹(shù)Decision Tree)。該模型選用一些特征作為決策變量,基于特定的閾值形成決策分支,最終形成樹(shù)狀的決策鏈條。    

3.支持向量機(jī)SVM)。在許多情況下,支持向量機(jī)都是二分類模型的首選。通過(guò)使用核函數(shù),即使基于線性不可分的數(shù)據(jù),也可獲得較好的分類精度。引入投票機(jī)制后,亦可將該模型應(yīng)用于多分類場(chǎng)景。

圖示.使用SVM進(jìn)行訓(xùn)練的過(guò)程。

 4.集成學(xué)習(xí)。當(dāng)單一的分類器性能不良時(shí),可以考慮集成多個(gè)弱分類器,形成一個(gè)強(qiáng)分類器??蛇x的集成學(xué)習(xí)模型有隨機(jī)森林等。

圖示.隨機(jī)森林分類過(guò)程。

 

  5回歸模型?;貧w模型主要用于預(yù)測(cè)連續(xù)變量(如量表得分)。可選的回歸模型有線性回歸(GLM)、多項(xiàng)式回歸等,也包含其變種,如LASSO回歸、嶺回歸、Elastic Net等。   

6.神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。當(dāng)沒(méi)有良好的手工選擇的特征時(shí),可以考慮選用深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(主要基于CNN來(lái)實(shí)現(xiàn))模型。該模型可以自動(dòng)從原始數(shù)據(jù)中提取特征,用于后續(xù)的預(yù)測(cè)任務(wù)。

圖示.一種卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)。

 

7.聚類。當(dāng)數(shù)據(jù)沒(méi)有標(biāo)簽時(shí),可以選擇無(wú)監(jiān)督學(xué)習(xí)算法,如K-means聚類。

 注:思影可以提供的機(jī)器學(xué)習(xí)模型包括但不限于以上內(nèi)容。其他模型如樸素貝葉斯(Naive Bayes)、線性判別分析(LDA)、主成分分析(PCA)、或上述模型的變種,亦可根據(jù)需求實(shí)現(xiàn)。您可以選擇其中的一種或多種進(jìn)行嘗試。

 

一、結(jié)果匯報(bào)&可視化 

    結(jié)果匯報(bào)內(nèi)容包括:

   1)對(duì)于分類模型,可匯報(bào)敏感性、特異性、總精度、曲線下面積等精度指標(biāo);

   2)對(duì)于回歸模型,可以匯報(bào)相關(guān)值、MSEMAE等精度指標(biāo);

   3)置換檢驗(yàn)的結(jié)果,如p值。


圖示.精度結(jié)果可視化案例。

圖示.ROC曲線可視化。

結(jié)果可視化內(nèi)容包括:   

1)對(duì)于分類模型,可繪制ROC曲線圖;   

2)對(duì)于回歸模型,可繪制相關(guān)圖;   

3)對(duì)于模型訓(xùn)練過(guò)程中發(fā)現(xiàn)的貢獻(xiàn)較大的特征,可繪制曲線圖、矩陣圖、圈狀圖、地形圖等。

圖示.頻譜特征結(jié)果可視化案例。

五、定制化服務(wù)

圖示.工程師在討論。 

  1.分析方法可定制。思影科技可根據(jù)您提供的模板文獻(xiàn),基于您的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),實(shí)現(xiàn)文獻(xiàn)中使用的數(shù)據(jù)分析方法。此外,未列出的分析方法,只要在思影科技的能力范圍內(nèi),盡力實(shí)現(xiàn)您的想法。

  2.分析代碼可定制。在沒(méi)有現(xiàn)有的軟件適用于您的數(shù)據(jù)分析需求時(shí),思影科技會(huì)與您協(xié)商,通過(guò)編寫(xiě)代碼實(shí)現(xiàn)您的想法,并提供代碼的完整實(shí)現(xiàn)。

  3.可視化方案可定制。如果您有特殊的可視化方案要求,也可與我們協(xié)商實(shí)現(xiàn)。

客戶與思影確定合作意向以后,思影會(huì)指定專門的工程師全程與客戶對(duì)接項(xiàng)目著手該項(xiàng)目數(shù)據(jù)處理,思影額外還將指派另一名工程師對(duì)項(xiàng)目全程進(jìn)行檢查,審核,把關(guān),確保數(shù)據(jù)處理質(zhì)量,思影將全程對(duì)客戶數(shù)據(jù)保密。



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